一旦发现孩子出现甲状腺炎的症状，家长需要马上带孩子就医治疗。目前，甲状腺炎的治疗主要采取以下方法：
1、替代疗法：用甲状腺制剂进行替代治疗，如L-甲状腺素钠4~5μg/kg·d以免影响生长发育，本病可以自然恢复，但进展十分缓慢。
2、手术治疗：有出现合并甲状腺癌、巨大甲状腺以甲状腺素治疗效果不佳、似新生物迅速增大者疑有恶变、有其他多种内分泌瘤者、甲状腺肿导致气管受压等情况下应进行手术治疗。
3、激素治疗：大剂量甲状腺素（100~200mg/d）可使甲状腺抗体滴度下降，肾上腺皮质激素虽有降低自身抗体的作用，但临床效果不显著，因而不主张采用此种方法。
此外，在甲状腺炎的早期到晚期也可采用不同的治疗方法：
早期：程度轻时患儿仅有轻度的甲亢症状，会表现出易劳累、轻度失眠、烦闷急躁等。程度重时，则会出现明显的甲亢症状，稍服治甲亢的药即可获良好效果，但也容易出现药物性甲低。也有的患儿因炎症的减轻，甲亢症状消失。疗效好，复发率高是本阶段的特点，因此，治疗方法中以减少复发为关键，多以药物治疗为主。
中期：此时患儿甲状腺组织经多次、反复的破坏，健康的细胞逐渐减少，逐渐出现甲低症状。这时期的患儿会出现甲亢症状，但化验指标会稍高或正常。因此，治疗时要慎用手术治疗和碘131的使用，以免导致病情加重。
晚期：甲状腺炎患儿补充甲状腺素后，化验指标虽然正常，很多人却时时感觉不舒适，有时还会感觉有甲亢症状。有一部分患儿因感染的加重出现甲亢指标和甲亢症状，即甲低转甲亢”。临床上，甲状腺炎患儿的每一次甲亢的出现，都预示着甲低的进一步加重。因此，晚期甲状腺炎的治疗方法中，在西药激素治疗无效的情况下，可以考虑中医治疗。