几乎所有种类的河豚都含河豚毒素（TTX），它是一种神经毒素，人食入豚毒0.5mg-3mg就能致死.毒素耐热，100℃8小时都不被破坏，120℃1 小时才能破坏，盐腌、日晒亦均不能破坏毒素。 毒素主要存在于河豚的性腺、肝脏、脾脏、眼睛、皮肤、血液等部位，卵巢和肝脏有剧毒，其次为肾脏、血液、眼睛、鳃和皮肤，精巢和肉多为弱毒或无毒。在熟制河豚时，一定要严格细心地除去河豚的内脏、眼睛，剔去鱼腮，剥去鱼皮，去净筋血，用清水反复洗净。
河豚毒素，tetrodotoxin，简称TTX，是一种能麻痹神经的剧毒，通常只需氰化钾五百分之一就可置人于死地的剧毒，中毒的人会因神经麻痹而窒息而死，其中毒素直接进入血液中毒死亡速度最快。但是这种毒素却有着很高的医用价值：
1、用作镇痛剂、麻醉剂，对于神经痛、肌肉和关节创伤产生的疼痛，对晚期癌痛有显著镇痛作用，且不成臆。用于局部麻痹要比一般局部麻经强上万倍，比普鲁卡因强16万倍，比狄布卡因(DIBUCCAINE)强1万倍。
2、用作搔痒镇静剂，对皮肤搔痒症可以止痒而促其痊愈。
3、用于呼吸镇静剂，治气喘和百日咳。
4、用于镇痉剂，治疗松驰肌肉痉挛，胃痉挛和破伤风痉挛等病的特效药。
5、由于河琢毒素具有充血作用，对阳屡和妇女阴冷也有效。
6、具有尿意镇静作用，对遗尿症有良效。
7、这种毒素还是生化试剂和皮肤防皱剂。