治疗性病的常见药物有：干扰素a2b凝胶、青霉素、头孢曲松、阿昔洛韦等。
在治疗时应注意：
1、必须明确感染的性质：如果产生泌尿系感染的症状，一定要明确是否为细菌性，然后针对细菌的种类用药。
2、必须鉴别下尿路感染还是上尿路感染，二者在治疗上有所不同，前者预后差，易复发;后者预后佳，很少复发。患者应到医院仔细检查。
3、血行性感染和上行性感染问题：感染分为血行性与上行性感染，二者在治疗上有所区别。血行性感染发病急剧，有高热寒战，全身症状明显，应用血浓度高的药物或用静脉药物;而上行性感染以膀胱刺激征为主，应用尿浓度高的药物和解痉药物。
4、必须查明泌尿系有无梗阻：因为泌尿系梗阻为引起感染的直接诱因，同时在感染后若有梗阻存在则不易治愈，易产生耐药性菌株，同时亦易复发。
对于性病的治疗，不能只强调药物对病原细菌的作用，单纯依赖抗菌药物，必须提高患者的的抵抗力和去除感染因素，方可有效控制感染。健康的性行为才是健康的有力保障。