1、原发性生殖器疱疹：潜伏期为2-20日，平均6日。患部先有烧灼感，表现为群集丘疹，可单簇或散在多簇，丘疹很快形成水疱，疱液中可有病毒。2-4日疱疹破裂形成糜烂或溃疡，伴有疼痛，随后结痂自愈，若未继发细菌感染，不留痕迹。好发部位为大阴唇、小阴唇、阴道口、尿道口、阴道、肛门周围、大腿或臀部，约90%累及宫颈。亦有原发疱疹仅累及宫颈，宫颈表面易破溃而产生大量排液。发病前可有全身症状如发热、头痛、全身不适等。几乎所有患者均出现腹股沟淋巴结肿大、压痛。部分患者出现尿急、尿频、尿痛等尿道刺激症状。病情平均2-3周缓慢消退，但愈后容易复发。
2、复发性生殖器疱疹：首次复发多出现在原发性生殖器疱疹皮损消退后1-4个月内。发病前有局部烧灼感、针刺感或感觉异常，随后群簇小水疱很快破溃形成糜烂或浅溃疡。复发患者症状较轻，水疱和溃疡数量少，面积小，愈合时间短，病程7-10日，破损多在4-5日内愈合，较少累及宫颈，腹股沟淋巴结一般不肿大，无明显全身症状。