一般情况下，不会有任何异样感觉，通常是在影响性生活和怀孕后检查才发现。发现以后，先不要着急，应到正规医院求助医生，并进行详细的检查。相关研究证明，阴道疾病所导致的不孕几率特别低，只有1%-5%的可能，因此如果这种情况没有影响平时的生活，可以先不急于手术切除。当双阴道影响了性生活、妨碍经血排除或者有生育要求而必须进行治疗的时候，可以到正规医院行阴道纵膈切除手术。
一般完全纵隔无症状者不须特殊处理，如引起性交困难、影响妊娠或分娩者，可在非孕时行纵隔切除。若临产时发现纵隔阻碍胎头下降，可沿隔中央部切断，分娩后缝合切源止血。因双阴道不孕的女性切除纵膈可能提高受孕机会。
对阴道斜隔的处理，应及早手术切除斜隔或作一菱形切除，手术比较简单，在局麻下即可完成。切口边缘应电凝止血或用肠线间断缝合，防止粘连造成手术失败。术后除注意局部卫生外，还应特别注意防止尿路感染， 保护好肾脏。
对有功能障碍的阴道横隔，必须尽早采用手术处理。不完全阴道横隔可行阴道横隔切开术。完全横隔可手术切开引流经血后，切除横隔，基底部创缘用细肠线间断缝合。术后填塞油纱布压迫扩张阴道，防止粘连或狭窄，必要时术后应配带阴道模具。对有宫腔或输卵管积血的病人，切除横隔后， 在填塞油纱布之前，应放置较硬的引流管，之后在引流管周围填塞油纱布，使积存的经血或积液引流通畅，并根据需要坚持使用阴道模具。