在藏医学上来说，本病的病因与饮食因素有关，由于所摄食物未能进入血液化成营养成分，反而化做恶液并经血管进入全身各组织，在甲状腺这一“有缘部位”被隆的结构素逆作用收缩聚积而成为坚硬难消的肿块，似青果核样，成为“滞癌”，发为瘿瘤。
甲状腺恶性肿瘤的发病机制尚不明确，但是其相关因素包括许多方面，主要有以下几类：
1、癌基因及生长因子：近代研究表明，许多动物及人类肿瘤的发生与原癌基因序列的过度表达、突变或缺失有关。
2、电离辐射：目前已查明，头颈部的外放射是甲状腺的重要致癌因素。
3、遗传因素：部分甲状腺髓样癌是常染色体显性遗传病；在一些甲状腺癌患者中，常可询及家族史。
4、缺碘：早在20世纪初，即已有人提出有关缺碘可导致甲状腺肿瘤的观点。
5、雌激素：近些年的研究提示，雌激素可影响甲状腺的生长主要是通过促使垂体释放TSH而作用于甲状腺，因为当血浆中雌激素水平升高时，TSH水平也升高。至于雌激素是否直接作用甲状腺，尚不明确。