1、月经是由体内的下丘脑垂体决定的，如果排除各种器质性病变 ，人流后月经不调主要是因为下丘脑垂体-卵巢这个内分泌生殖轴生理功能发生失调引起的，医学上称其为功能性子宫出血。一般来说，功能性子宫出血包括以月经周期和行经期改变为主的，如月经先期、月经后期、月经先后不定期、行经经期过长过短、闭经等 ；以经量改变为主的，有经血过多、经血过少、经血淋漓不尽等。
2、妇女发生月经是由大脑皮层、下丘脑、脑垂体、卵巢和子宫相互作用的结果，受神经内分泌调节。当人处于过分紧张、恐惧、忧伤、过度劳累和手术等情况时，都能通过神经内分泌系统来抑制下丘脑、脑垂体、卵巢、子宫的功能，从而导致月经异常。
3、人流后胎盘绒毛膜促性腺激素骤然消失，使卵巢一时不能对垂体前叶分泌的促性腺激素发生反应，因而也会出现月经不调。
4、在人流过程中，过多地损伤了子宫内膜基底层，则子宫内膜不能再生，这样使病人发生长期闭经。