滴虫不仅寄生于阴道，还常侵入尿道或尿道旁腺，甚至膀胱、肾盂以及男性的包皮褶、尿道或前列腺中。滴虫性阴道炎是感染了阴道毛滴虫后引起的一种阴道炎症。是最常见的阴道炎症之一。临床上以白带增多、质稀有泡沫、秽臭，阴道瘙痒为主要表现。发病是由于感染的阴道毛滴虫消耗了阴道内的糖原，破坏了阴道的自净防御机能，继发细菌感染所致。
滴虫感染时，阴道的PH值一般为5.0-6.0，而正常阴道的PH值应为4.2-5.0。阴道内环境酸碱度的改变会使精子的活动力受到影响。另外，滴虫能够吞噬精子，且患滴虫性阴道炎时，阴道内脓性分泌物大量增多，分泌物中含有大量的白细胞，这些都会妨碍精子的成活，使精子数量减少，活动度又不好，就很有可能引起不孕。但这并不是不可逆的，大多数人在滴虫病治愈后，生育能力也可以得到恢复。