1、免疫系统发育不够成熟，功能尚欠完善。
2、新生儿尚未接触过子宫外环境的各种病原，也没有接触过食物蛋白等种类繁多的抗原性物质。
3、孕期受到通过胎盘的母亲抗体的影响，使新生儿存在着生理性免疫低下。
方案一：合理营养
新生儿期营养需求量高，但消化代谢功能有限。因此，对营养既要求足够量来保证生长发育的需要，又不能过量喂养，以免造成新生儿胃肠道的过重负担，适当掌握合理营养对增强体质和抵抗力最具有决定性的影响。
每天摄取均衡的营养才能满足身体的需求及提高免疫力。蛋白质是构成免疫细胞和抗体的主要成分，如蛋白质缺乏会造成免疫机能下降。维生素C能刺激身体制造干扰素，补充足够的维生素可增加抗体，清除病毒和细菌，从而增强免疫力。其它如-胡萝卜素及营养素中的叶酸、维生素B12、烟碱酸、泛酸、铁、锌和酶等也都与免疫能力有关。
方案二：母乳喂养
母乳比代乳品含有更多的免疫活性物质，它可供给新生儿所需的全部营养物质：蛋白质、脂肪、乳糖、维生素、铁、尤其是母乳中含有抗感染的抗体(免疫球蛋白)及抗感染的活性白细胞、双歧因子、溶菌酶等，它们具有增强免疫功能，阻止有害菌的生长，可减少宝宝感染的机会。
方案三：预防接种
新生儿时期虽然从母体来的免疫球蛋白提供了一些抗体，但对于许多传染病仍是一个高度的易感者。预防接种是抵抗病菌的有效方法，可以通过早期有效的预防接种来防止对新生儿危害最大的传染病的发生，如结核病、乙型肝炎等。
方案四：新生儿按摩
按摩是通过新生儿皮肤感官温和的刺激，引起全身神经、内分泌及免疫等系统的一系列良性反应，可促进胃肠激素的分泌，有助于增加小儿的食量，促进食物消化、吸收和排泄，加快体重的增长。按摩的同时还活动宝宝的全身肌肉，使身体发育得更健壮。另外，皮肤刺激对增强免疫功能有直接和间接的影响，有益于新生儿的体格与心智的健康发育。
增强新生儿的抵抗力，减少宝宝感染机会，除了均衡、足够的营养，提倡母乳喂养、预防接种以及积极有效地增强体质之外，宝宝的护理者养成勤洗手的好习惯及加强居室内通风也是非常重要的。