1、先天性因素引起的小睾症，可以用一些雄性激素，促进男性第二性征的发育，使生殖器发育正常，阴毛发育明显，富有男性特征，促进性欲，维持正常的性功能。但无论用什么方法治疗，只能促进性功能及第二性征的发育，也不能恢复生育能力。小睾症患者，由于睾丸尚可分泌一定量的男性激素，仍可以有性欲和性功能，也可有正常的射精，但精液中无精子或精子极少，97%的患者呈不育症，他们以后只能借精子生孩子。
2、由于精索静脉曲张造成的睾丸大小不一，只要施行精脉曲张手术，问题便迎刃而解。但对于先天性因素引起的小睾症，如对于克氏综合症的治疗，可用丙酸睾丸酮50毫克，肌肉注射，每周2次，或甲基睾丸素5毫克，日服3次，可促进男性第二性征的发育，促进性欲，维持正常的性功能。