早泄的病因不只是心理性和阴茎局部性因素，还应考虑泌尿、内分泌及神经等系统疾病因素。
1、心理因素。引起早泄心理性因素很多，如许多人因种种原因害怕性交失败、情绪焦虑，而陷入早泄;年轻时惯用手淫自慰者，总以快速达到高潮为目的;性知识缺乏，仅以满足男性为宗旨;夫妻不善于默契配合;感情不融，对配偶厌恶，有意或无意的施虐意识;担心性行为有损健康，加剧身体的某些固有疾病;性交频度过少或长时间性压抑者;以及女方厌恶性交，忧心忡忡，迫于要求快速结束房事等。以上原因皆可导致男性早泄，甚至出现连锁反应，影响勃起能力。
2、器质性因素。引起早泄的器质性因素正在探讨中，有认为脊髓系统疾病如多发性硬化症或脊髓肿瘤、癫痫发作或大脑皮层器质性病变如脑血管意外，可引起射精失控。也研究认为糖尿病、心血管疾病、骨盆骨折、泌尿生殖系统疾病如尿道炎、前列腺炎精囊炎以及前列腺增生，均与早泄相关。