男性免疫性不育主要和精子相关。免疫性不育的原因主要包括三个方面，即精液中免疫抑制因子的缺乏、精子的自身免疫和血睾屏障受损。免疫性不育的原因具体为：
1、精液中免疫抑制因子的缺乏：正常精液中含有前列腺素E和一种糖蛋白，具有免疫抑制作用。如果将男性的精液在室温中进行液化分离，就会分成澄清的精浆和沉淀的精子两个部分，均含有多种蛋白质。如果精液中缺乏免疫抑制因子，这种蛋白质的结构就会发生变化成为抗原，这种抗原在人体内多达30多种，精子抗原成分的有精子特异抗原、组织相容性抗原、血型抗原、乳酸脱氢酶等酶抗原和精子附着抗原等。其中精子特异性抗原可刺激机体产生特异性抗体，从而影响精子的发育与成熟，导致形成男性免疫性不育。
2、精子的自身免疫：机体能够对自身抗原形成抗体或者是致敏淋巴细胞。自身的组织如血清、精子等虽然携带着多种的抗原，但是因为它的效价很低，所以一般不会产生免疫应答。如果自身耐受性遭到破坏或者自身抗原性改变，又或免疫活性细胞发生突变，如进行睾丸外伤或外科手术、输出管道（如附睾、输精管）梗阻等，使免疫系统对自身产生免疫应答，从而使精子发生自身免疫反应，导致不育。
3、血睾屏障受损：血睾屏障即睾丸组织与流经睾丸的血液之间的防护层。这种血睾屏障具有防止精子与免疫系统接触，防止有害物质损伤精子及为精子提供良好的生成环境的作用。如果血睾屏障遭到生物、化学、物理等因素的破坏，精子或其可溶性抗原溢出，可导致机体产生抗精子自身抗体，从而抑制精子的活动与受精，造成男性不育。