主要是生精障碍和输精障碍。
1、精液异常：性功能正常，先天后后天原因所致精液异常，表现为无精、弱精、少精、精子发育停滞、畸精症等。
2、性功能异常：外生殖器发育不良或勃起障碍、不射精、逆行射精等，使精子不能正常射入阴道内，均可造成男性不育。
3、免疫因素：在男性生殖道免疫屏障被破坏的条件下，精子、精浆在体内产生抗精子抗体，使射出的精子产生凝集而不能穿过宫颈黏液。
不明原因不孕：属于男女双方均可能同时存在的不孕因素。约占不孕病因的10%-20%，是一种生育力低下的状态，可能的病因包括免疫因素、潜在的卵母细胞、卵子质量异常、受精障碍、隐性输卵管因素、植入失败、遗传缺陷等因素，但应用目前的检测手段无法确诊。