精索静脉曲张的病因主要是由于精索静脉血流淤积而引起，而导致精索静脉血流淤积的原因有以下几种：
1、生理因素
原发性精索静脉曲张多发生于30岁以前。由于这个时期男性阴囊及其内容物血液供应丰富，性欲旺盛，过度性刺激可反射性地引起盆腔及精索内静脉充血，从而导致精索静脉曲张的发生。
2、解剖因素
左、右侧精索静脉均可分别或同时发生曲张，但以左侧静脉曲张发病率高。这是因为左侧精索静脉约比右侧长8-10cm，并呈直角进入肾静脉，静脉压力较高;左精索静脉可能受结肠压迫，左肾静脉在主动脉与肠系膜动脉间可能受压，这些压迫影响精索静脉回流，形成近端钳夹现象;右髂总动脉可能压迫左髂总静脉，使左精索静脉回流受阻，形成所谓远端钳夹现象。
3、疾病因素
静脉壁及其周围结缔组织薄弱或提睾肌发育不全、静脉瓣膜缺损或关闭不全，都容易导致精索静脉曲张的发生。腹膜后肿瘤、肾肿瘤、肾积水等压迫精索内静脉可引起症状性或继发性精索静脉曲张。原发者平卧时很快消失，继发者常不消失或消失很慢。
4、生活因素
长久站立，导致腹压增加也是精索静脉曲张的发病困素之一。也有研究表明，精索静脉曲张与手淫有一定关系。