1、念珠菌抗体检查：用免疫双扩法或胶乳凝法可检出白色念珠菌抗体。
2、镜检：刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。将待检标本用10%氢氧化钾或生理盐水制片，镜下可见成群的卵圆形孢子和假菌丝，如找到较多的假菌丝时，说明念珠菌处于致病阶段。念珠菌性龟头炎可在病变的龟头、包皮上取材镜检或培养可找到念珠菌。滴虫性龟头炎可在分泌物上找到滴虫。
3、染色检查：也可用革兰染色法，刚果红染色或pas染色法染色后镜检，其阳性率均比直接镜检法高。革兰染色，孢子和假菌丝染成兰色：刚果红和pas染色，孢子和假菌丝则染成红色。
4、分离培养：涂片检查阴性的患者，可进行念珠菌培养。直接镜检或染色后镜检，可见大量芽孢子，可初步诊断为念珠菌感染。