龟头炎的发作与包皮过长密切相关。由于包皮过长和包茎，包皮内的分泌物难以及时有效地清除，细菌大量生长繁殖，导致包皮内分泌物增多、出现包皮垢和异味，严重时引起局部炎症，导致包皮龟头炎。龟头炎还可由一些非感染因素和感染因素所引起。
1、非感染因素：包括局部创伤、摩擦等伤害，避孕药、肥皂和清洁剂等刺激均可引起龟头炎。局部可表现为水肿性红斑、糜烂、渗液甚至出血，若继发细菌感染可化脓并形成溃疡面。患者疼痛明显，行动不便。临床上称之为急性浅表性龟头炎。
2、生殖器卫生：如果不注意经常清洗外生殖器，或清洗时没有将包皮上翻，包皮皮脂腺的分泌物就会积存在包皮下，形成像豆腐渣样的包皮垢。包皮垢是细菌的良好培养剂，不及时清除就容易诱发龟头炎。
3、病菌的感染：念珠菌感染、滴虫感染、阿米巴原虫感染等均可引起龟头炎。