肠套叠有手术疗法和非手术疗法两种。
手术疗法：对肠套叠比较严重的宝宝，应采取剖腹复位套叠肠管的手术疗法。手术后，家长要定时帮宝宝变换体位，宝宝的饮食要以稀、少、清淡并富于营养为原则，量与质要逐渐增加，才有助于肠功能的恢复。
非手术疗法：
1、空气灌肠复位法。宝宝患病不超过12小时，全身情况良好，可做空气灌肠复位。超过24小时，全身情况明显较差，如腹胀严重者，禁忌做空气灌肠。
2、钡剂灌肠复位法。就是将钡剂灌入直肠内，通过荧光板，观察肠套叠阴影，确诊后，按规定增加压力，使肠套叠复位的治疗方法。
灌肠后，一般会让宝宝口服炭末，然后观察其能不能随大便一起排出。如能随大便排出，证明复位成功。
采取非手术疗法的时候需要注意给宝宝保暖，防止着凉、腹泻，饮食要以半流质为主，以免造成套叠的再次发生。