1、免疫功能不健全：宝宝刚出生，身体还没适应，抵抗力差，免疫功能不健全。一旦不注意保暖，会容易患上感冒等疾病。
2、生理构造因素：新生宝宝的上颌骨和颅骨发育不全，鼻和鼻腔相对短小；鼻腔内鼻毛稀少；鼻腔粘膜柔嫩，血管、淋巴组织相对成人较丰富等。一旦遇到寒冷空气和含菌量较多的气流，都可直接刺激鼻咽部，使鼻咽部血管粘膜充血肿胀，鼻腔分泌物增多并结痂，使原来已经狭小的鼻腔更加狭窄，甚至闭塞，进而使氧气的吸入量减少，二氧化碳排出受阻。
3、疾病因素：新生儿鼻塞常见于上呼吸道感染。其次，鼻腔本身的疾患如鼻息肉、鼻中隔弯曲、鼻腔异物或肿瘤等都可使宝宝鼻塞。此外，某些过敏反应也可引起鼻塞。
4、药物因素：某些药物也可以引起鼻粘膜的充血肿胀而导致鼻塞，如孕妈服用降压药利血平，都可引起新生宝宝鼻塞。