幼儿急疹的发病原因主要是人类疱疹病毒6型感染以及宝宝免疫力低下所导致，具体为：
1、人类疱疹病毒6型感染。
幼儿急疹病原体为人类疱疹病毒6型。由于人体对此病毒感染后会出现免疫力，所以很少出现再次感染，因此病毒的传播原不仅是已患病的宝宝，更为常见的是父母及家人中的健康带病毒者，可经呼吸道飞沫传播。胎儿可以通过胎盘从母体得到抗体，出生后4个月时抗体阳性率为25％，11个月时为76％，5岁时90％，17岁时达98％。幼儿急疹多见于6-18个月的宝宝，3岁后少见，春、秋雨季发病较多，没有男女性别的差异。
2、宝宝抵抗力低下。
1岁以内的宝宝发育不完全，抵抗疾病的能力差。特别是6个月后的宝宝，来自于母体的抗体等抗感染物质以及铁等营养物质水平慢慢下降，而宝宝自身合成抗体的能力还不完善。所以，宝宝抵抗感染性疾病的能力逐渐下降，容易患各种感染性疾病，尤其常见的是感冒、发烧。