预防新生儿腹泻主要是注意严格消毒喂养新生儿用的奶瓶、奶锅等物。一般奶瓶和奶嘴用水煮30分钟即可杀死所有的细菌。牛奶要煮沸饮用。禁止给新生儿吃在冰箱内放置时间较长的食品及饮料和不干净的食物。避免长期大量使用广谱抗生素。
新生儿腹泻是一种很容易预防的疾病，根据腹泻发生的原因，应注意以下几点：
1、饮食卫生要注意。食品要保持新鲜、清洁，变质的食物千万不要喂宝宝，食具也必须注意消毒。
2、母乳喂养最优质。母乳是最符合宝宝的营养需要和消化吸收的，而且母乳中含有大量可以提高宝宝免疫力的成分，宝宝出生后最初的几个月应该提倡母乳喂养。喂养时要坚持正确的喂养方法，做到按需哺乳，在夏季及宝宝有病时不宜断母乳。
3、添加辅食要及时。无论是母乳喂养还是人工喂养，宝宝的生长发育迅速，爸爸妈妈都应按时给宝宝添加辅食。添加辅食时，要注意宝宝的消化吸收能力，每次只能增加一种，由少到多，一点点地增加，确保宝宝的营养需要。
4、保证饮食质量。宝宝出生后头3个月内，如果母乳不足，可适当用牛奶或豆浆补充，但都需要适当稀释．以便宝宝能充分消化和吸收。母乳不够或母乳太少采取混合喂养及人工喂养时，应注意饮食调配，过多或过早地喂给宝宝米糊或粥食等食品都是不恰当的，容易发生碳水化台物消化不良及影响宝宝生长发育。当宝宝食欲不振时，不要强制宝宝进食。
5、要增强宝宝体质。天气温暖的时候可以多带宝宝到户外活动，提高宝宝对自然环境的适应能力，让宝宝的体质得到增强，机体抵抗力得到提高，远离各种疾病感染。
6、不要让宝宝受到不良刺激。要防止宝宝在日常生活中过度劳累、被惊吓或精神过于紧张。
7、注意夏季的卫生及护理。给宝宝添衣减衣要合理，过冷过热都不行，夜晚睡觉时要注意腹部的保暖。平常要多给宝宝喝水，多进行温水浴，要饮食有度，不要吃脂肪过多的食物。
8、体质较弱的宝宝要加强护理。特别是营养不良、佝偻病及病后体弱的宝宝，更应注意饮食卫生，避免各种感染。对刚病发的腹泻治疗要及时，不要延误形成严重的腹泻。
9、防止交叉感染。因为感染性腹泻容易流行，宝宝或家长一旦出现腹泻必须隔离治疗，粪便要消毒处理。