一般比较轻的生理性腹泻无需治疗，妈妈可以继续哺乳。这样宝宝机体会逐渐适应母乳中的前列腺素，乳糖酶亦会逐渐发育成熟，酶的活性增加，逐步能够分解、消化和吸收乳糖，并随着增加辅食逐渐好转。
在饮食方面，可以喂鲜豆浆100ml加5g葡萄糖代乳，对于生理性的腹泻即可得到控制。豆浆喂养不宜长期单独应用，宜逐步加鱼蛋白。具体方法是用180ml米汤冲调5g鱼蛋白，一般来说，宝宝每日喂哺3顿就可以了。
对于严重的母乳性腹泻，应该及时带宝宝到医院进行治疗。一般可以使用中药治疗，同时也可以使用针灸的方法进行治疗，效果很好。
需要提醒的是，宝宝腹泻经过治疗，病情有所好转以后，也不能短时间恢复到原来的饮食，要慢慢添加，以免再次引起腹泻，妈妈应该缩短每次哺乳的时间。如再次发生腹泻，治疗就更困难了。