1、原发疾病的治疗
如能发现呼吸暂停病因者，必需对原发疾病给予积极的治疗。如纠正贫血，低血糖等。
2、呼吸暂停的治疗
如呼吸暂停的原因不能确定或原因确定后（如脑室内出血等）无特殊治疗者可采用下列方法；
（1）供氧：呼吸暂停患儿都需供氧，往往由于纠正了；被认识的低氧血症而减少呼吸暂停的发作。一般可选用面罩或头罩，在给氧期间需给监测氧合，应保持PaO26.65-10.76kPa（50-80mmHg）脉搏氧饱和度在90%左右，以防高氧血症。
（2）增加传入冲动发作时给予患儿托背、弹足底或给予其他的触觉刺激常能缓解呼吸暂停的发作，但是其缺点是需要专人守护。将患儿置于振动水床，可以通过增加前庭的位觉刺激而增加呼吸中枢的传感神经冲动，减少呼吸暂停的发作。
3、药物治疗
（1）茶碱或氨茶碱：最常用的治疗药物，属甲基黄嘌呤类。茶碱可能直接刺激呼吸中枢或增加呼吸中枢对CO2的敏感性，使呼吸频率增加，减少呼吸暂停的发作。其机制是由于抑制磷酸二酯酶，增加cAMP和儿茶酚胺的水平。
使用方法为：负荷量5mg/kg用适量10%葡萄糖稀释后，静脉内输入，15-20min内完成。维持量1-1.5mg/kg，每8-12h一次，静脉内给药或口服。茶碱的副作用有心动过速、低血压、烦躁、惊厥、高血糖和胃肠道出血等。副作用的发生志药物血浓度有一定关系。
血浓度过于15-20mg/L时，首先出现的是心动过速（≥180次/min），以后出现抖动、激惹、腹胀、呕吐、喂养困难，药物浓度＞50mg/L时，可发生惊厥，心律紊乱。
2、枸橼酸咖啡因：作用机制类似茶碱，但其半衰期长，毒性较低。临床推荐剂量为：负荷量20mg/kg（相当于咖啡因基质10mg），静脉或口服用药，24-48h后用维持量5mg（kg.d），每天给药1次，静脉或口服。药物有效血浓度在8-20mg/L，每3-4d测定1次。
当血浓度＞50mg/L时，可出现恶心、呕吐、心动过速、心律紊乱、利尿和烦躁，甚至惊厥。苯甲酸钠咖啡因不用于早产儿呼吸暂停，因苯甲酸钠可与胆红素竞争白蛋白结合点，增加核黄疸的危险。
3、多沙普伦（Doxapram）呼吸中枢兴奋药：文献报道当茶碱和咖啡因治疗无效时，应用本药有效。用法：1-1.5mg/（kg.h），静脉持续点滴。当呼吸暂停控制后，减量至0.5-0.8mg/（kg.h），最大剂量可至2.5mg.（kg.h）。一般疗程为5d，必要时可处长疗程。
有效血浓度＜5mg/L.毒性作用：抖动、抽搐、心率增快、高血糖、腹胀、呕吐、轻度肝功能损害和高血压，停药后可消除。有心血管疾病或抽搐禁用。由于需要静脉持续点滴和其毒性作用，限制了本药的应用。
4、持续气道正压（CPAP） 一般供氧不能缓解呼吸暂停者可用CPAP，常用的是双侧鼻塞或气管内插管方法，压力在0.3-0.5kPa，其机制可能与纠正缺氧有关。
5、机械通气部分患儿应用上述各种方法治疗后，仍频发呼吸暂停并伴有低氧血症或明显的心动过缓时，可用机械通气。无肺部疾患者呼吸机预调参数：FiO20.25-0.3或上机前的氧浓度。pip1.4-1.9kPa（15-20cmH2O），呼吸频率15-25次/min，吸气时间0.5-0.6s。
6、药物撤离和家庭监护：当呼吸暂停缓解后，可考虑信用茶碱。若停药后呼吸暂停复发者应重新给予茶碱治疗，必要时可维持用药至妊娠后52周或出生后4周。