新生儿肝炎综合征的预防应注意以下几点：
1、应在母孕期避免各种疾病感染及患肝炎，同时对患儿应早诊断、治疗。
2、预防新生儿乙型肝炎：
（1）用乙肝人类免疫球蛋白(HBIG)作被动免疫
对患有急性期或恢复期乙肝以及HBV携带的孕母
A、分娩前3个月，每月注射1次HBIG，每次200U。
B、对其所生的婴儿于，生后24h内、1月龄、6月龄各注射HBIG 100U。
（2）应用乙肝疫苗做主动免疫
分为血源疫苗与基因疫苗。
基因疫苗优点：用量小，安全性高，可避免受到血源携带的其他极微量或未知微生物感染。
方法：对HBsAg阳性和（或）HBeAg阳性的产母所生的婴儿按0、1、6程序（出生24h内、1个月、6个月）各在不同侧部位注射接种1此疫苗。12个月时随访，测保护性抗体（HBsAb）。3-5年进行加强接种1次。
接种后6个月测HBsAg阳性示接种失败。15个月仍阳性示慢性携病毒者。15个月时HBsAg阴性，抗HBs阳性示婴儿得到保护。
（3）乙肝疫苗和乙肝人类免疫球蛋白的联合应用。