严重病例多有新生儿破伤风并发症存在，最常见的新生儿破伤风并发症有窒息、肺炎、脐炎、脐出血、败血症、硬肿症及心力衰竭等。特别是肺部感染，是造成新生儿死亡的主要原因，应积极抢救。
1.窒息：
由于喉头呼吸肌持续性痉挛和粘痰堵塞气管所致;
2.肺部感染：
喉头痉挛、呼吸道不畅、支气管分泌物郁积、不能经常翻身等都是导致肺炎肺不张的原因;
3.酸中毒：
呼吸不畅、换气不足而致呼吸性酸中毒，肌强烈收缩、禁食后体内脂肪不全分解，使酸性代谢产物增加造成代谢性酸中毒;
4.循环衰竭：
由于缺氧、中毒，可发生心动过速，时间过长后可形成心力衰竭，甚至发生休克或心搏骤停。这些并发症往往是造成病人死亡的重要原因，应加强防治。
5、 肺炎、脐炎、脐出血、败血症、硬肿症及心力衰竭等。抽搐频繁，不能咳出呼吸道分泌物，极易造成痰液阻塞。
虽然新生儿破伤风是一种严重疾病，过去的病死率很高，但只要我们掌握它的规律，熟悉治疗原则，采用综合疗法，大多数病例还是可以治好的。本病的危险期大概是起病后10天左右，如能度过此期，则由于本病的自限性，破伤风毒素与神经细胞的结合是暂时的，可以恢复的，因此可望痊愈而不致产生后遗症。