对于扁桃体发炎引起的发热，是需要服用消炎的药物，同时服用退热的药物来进行治疗。也可以通过注射头孢或者是青霉素等来进行治疗。消炎的药物可以选择头孢或者是阿莫西林克拉维酸钾。退热的药物可以选择美林、巴米尔等。平时多喝水。
扁桃体发炎要重视，它有传染性，有一个医生强调以下几个措施：
1、服用板兰根冲剂。
2、卧床休息。
3、经常喝水。
4、不吃刺激食物。
5、温淡盐水漱口。
6、热水袋在患处敷。
单纯的扁桃体发炎，要注意进食清淡，不要吃刺激性食物，多喝水，吃软食。若发展为化脓性的，除了以上措施外，还要消炎，另外，化扁会伴有高热，要注意降温，及时更换汗湿的衣服，食物要营养丰富，易消化，易咀嚼吞咽。扁桃体炎采用减轻症状的支持治疗联合抗感染的药物治疗。支持治疗包括多喝水，盐水嗽口等。
大部分病毒感染所造成的扁桃体炎是属于自限性的，就是一个免疫功能正常的婴幼儿，只要注意适当补充水分、观察食欲及活动力的变化情形，在喉咙疼痛可以忍受的范围内，尽量鼓励以温凉顺口的食物（如布丁、豆花等），并维持饮食的正常、作息规律，一般不需特别的治疗，三至五天就可以康复。
有些扁桃体发炎则因为病原菌较强，或病童抵抗力较弱，医师观察怀疑是细菌（特别是链球菌）)的感染时，可能会建议使用口服抗生素治疗，但要注意疗程一般约需十天，切勿太早自行停药，而造成慢性反复性发炎或其它严重的并发症（如：心脏、肾脏的损伤以及肺炎等），同时也要配合医师的指示返诊追踪。
非常严重的感染需要住院治疗。无力吞咽会导致脱水，这时最好静脉补液，同时静脉输抗生素也更有效。