婴儿肠绞痛是婴儿生命中一个最难以解释的现象之一。没有人知道为什么有些宝宝会比其他宝宝肠绞痛得厉害，不过，关于肠绞痛的理论倒是不少。原因之一可能由于有些婴儿的消化系统更不成熟或更敏感。婴儿消化道里用于分解食物的消化酶或消化液还很少，尤其是淀粉酶。所以，当母乳或者配方奶里的蛋白质或糖类过高时，婴儿就可能会因消化液不足，造成肚子胀气疼痛（肠绞痛）。另外，婴儿在哭闹过程中也会吞下过多空气，这也能造成胀气。
还有一些专家认为，婴儿一阵一阵长时间的哭闹是一种发泄，因为他们正在发育的神经系统还不能很好地处理周围环境中的各种刺激因素。到了晚上，有些婴儿就是因为不能再接受周围环境中的视觉图像、声音和感觉，需要通过哭这种方式来释放，这会使婴儿大量吞气，从而导致肠绞痛。
总之，婴儿吸乳时吞入大量空气、哭吵时亦吸入较多空气，形成气泡在肠内移动致腹痛。喂奶过饱使胃过度扩张引起不适，饥饿时婴儿也阵阵啼哭。婴儿对牛奶过敏诱发肠绞痛。兴奋型婴儿对各种刺激的反应也会引起婴儿肠绞痛。