1、皮内接种卡介苗后2-3天内，在接种部位的皮肤上略有红肿，为非特异性反应，会很快消失。大约2个星期后，局部有产生红肿的丘疹样硬块，有时软化为白色小脓包，以后自行溃破形成浅表溃疡，一般不超过0.5厘米，有少量脓液，然后逐渐结痂，痂皮脱落后留有轻微疤痕。前后历时2-3个月，是卡介苗的正常反应。
2、接种卡介苗后有极少数人会出现严重皮疹，紫癜，休克等异常反应，这个时候要及时诊治。
另外，接种中偶尔会发生下列反应：
（1）淋巴结炎症：接种后1-2个月左右，颈部、腋下、锁骨上下等淋巴结肿大（大于1.0cm）。反应过强者，淋巴结肿大明显，可形成脓疡或破溃，或在接种处有小脓疤。皮内注射者反应往往较划痕法者强，另外旧结核菌素（OT）试验呈阳性者，接种后也可产生较强反应。
（2）类狼疮反应：与结核菌菌株剩余毒力有关。
（3）疤痕：因丰富的肉芽组织形成疤痕突起，有时呈疤痕瘤，多见于不作OT试验而直接皮上划痕接种者。
上述过程一般要持续2个月左右。接种卡介苗后还会常引起接种部位附近的淋巴结肿大（多为腋下淋巴结肿大），这是正常反映，随着接种部位的愈合，肿大淋巴结也会自行消退。可以用热敷的方法促其消退，如果有脓疡形成，可以请医生用注射器将脓液抽出，促进愈合，一般不会对孩子的健康有影响。