蜂巢有一定的药用价值，临床上也常用新鲜的蜂巢治疗鼻炎。蜂巢的化学成分很复杂，主要含有蜂蜡、树脂、油脂、色素、鞣质、糖类、有机酸、脂肪酸、甙类、酶和昆虫激素等。过敏性鼻炎大多数是由于吸入灰尘、花粉、感染霉菌引起的，蜂巢富含激素和多种的维生素，是调节内分泌和滋补强身的佳品。蜂巢治疗鼻炎，可取5克带蜜粉的蜂巢，用开水煎服或者嚼服，一日三次，连续服用2-3个月，即有明显的治疗效果。蜂巢中的蜂胶等物质对细菌、真菌、病毒有抑制喝杀灭的作用，蜂巢中的王浆、花粉复合营养成分，充分促进人体免疫功能提高，能够使鼻咽炎患者症状得到缓解并消失。
除了治疗鼻炎外，蜂巢对肝炎、风湿性关节炎等疾病也有一定的疗效。研究表明，蜂巢制剂有促进机体细胞免疫功能的作用，蜂巢浸液既对乙型肝炎表面抗原有灭活作用，也对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、伤寒杆菌和普通变形杆菌等都有很强的抑制力；对烟曲霉、黄曲霉、茄镰菌、明串珠菌等真菌也有抑制作用。