目前肝血管瘤的确切发病原因尚不明确，关于发病原因，主要有以下几种学说：
1、先天性发育异常学说。目前多数学者认为肝血管瘤的发生为是先天性肝脏末梢血管畸形导致的，一般认为在胚胎发育过程中，由于肝血管发育异常，所以引起了血管内皮细胞异常增生，从而形成肝血管瘤；
2、激素刺激学说。有研究表明女性在青春期、怀孕、使用口服避孕药后可使肝血管瘤的生长速度加快，因此考虑女性激素可能也是肝血管瘤的致病机制之一；
3、其它学说。关于肝血管瘤的其它发病原因学说，还包括：
（1）毛细血管组织感染后变形，引起毛细血管扩张，导致肝组织局部坏死后血管扩张形成空泡状，其周围血管充血扩张；
（2）肝内区域性血循环停滞，致使血管形成海绵状扩张。