治疗外阴阴道假丝酵母菌病的关键在于消除诱因，要根据患者情况选择局部或全身应用抗真菌药物。若有糖尿病应给予积极治疗，及时停用广谱抗生素、雌激素及皮质类固醇激素。勤换内裤，用过的内裤、盆及毛巾均应用开水烫洗。不过因为产后女性群体比较特殊，尤其是还在哺乳期的女性，用药上尤其要遵从医生的建议，不能擅自用药，以免影响宝宝的健康。
1、单纯性外阴阴道假丝酵母菌病的治疗：可局部用药，也可全身用药，主要以局部短疗程抗真菌药物为主。全身用药与局部用药的疗效相似，治愈率80%~90%。唑类药物的疗效高于制霉菌素。
（1）局部用药：可选用下列药物放于阴道内：
①咪康唑栓剂，每晚1粒(200mg)，连用7日;或每晚1粒(400mg)，连用3日;或1粒(1200mg)，单次用药。
②克霉唑栓剂，每晚1粒(150mg)，塞入阴道深部，连用7日;或每日早、晚各1粒(150mg)，连用3日;或1粒.(500mg)，单次用药。
③制霉菌素栓剂，每晚1粒(10万U)，连用10~14日。
（2）全身用药：对不能耐受局部用药者、未婚妇女及不愿采用局部用药者，可选用口服药物。常用药物：氟康唑150mg，顿服。也可选用伊曲康唑每次200mg，每日1次，连用3~5日;或采用1日疗法，400mg分2次口服。
2、复杂性外阴阴道假丝酵母菌病的治疗：多数患者复发机制不明确。抗真菌治疗分为初始治疗及维持治疗。
(1)初始治疗若为局部治疗，延长治疗时间为7~14日;若口服氟康唑150mg，则第4日、第7日各加服1次。
(2)常用的维持治疗：氟康唑150mg，每周1次，共6个月;或克霉唑栓剂500mg，每周1次，连用6个月；或选用其他局部唑类药物间断应用。
(3)治疗注意事项：在治疗前应作真菌培养确诊。治疗期间定期复查监测疗效及药物副作用，一旦发现副作用，立即停药。
3、妊娠合并外阴阴道假丝酵母菌病的治疗：局部治疗为主，7日疗法效果佳，禁用口服唑类药物。
4、性伴侣治疗：无需对性伴侣进行常规治疗。约15%男性与女性患者接触后患有龟头炎，对有症状男性应进行假丝酵母菌检查及治疗，预防女性重复感染。
5、随访：若症状持续存在或诊断后2个月内复发者，需再次复诊。