苦荞茶对人体有多种保健功效，一般情况下，大多数人饮用都无副作用，但要注意个别特殊的情况。
1、低血糖人士慎喝。苦荞茶有显著的健胃消食功效，所以应在饭后饮用。如果饮用者处于饥饿状态，腹中已经没有食物的时候再大量喝苦荞茶的话，肯定会加重饥饿感，特别是低血糖人士，此时会出现血糖下降的不适症状，因此需要特别注意。
2、过量会出现反酸、腹泻。苦荞可以辅助调节胃酸过多症状，但苦荞偏寒性，所以胃寒或者有胃病的人群过多食用，会造成反酸腹泻的现象。
3、皮肤瘙痒、头晕、哮喘等过敏症状。少部分人群食用荞麦食品后会引起皮肤搔痒、头晕、哮喘等过敏症状，所以黑苦荞过敏史者谨慎食用。
4、低血压人群慎用。苦荞茎、叶、花、果天然原料中自身所含芦丁，可能有降血压、降血糖、降血脂作用，低血压、低血糖及严重体型瘦弱病人请谨慎食用。