一、临床皮肤检查：可见四肢肢端散在分布的凸起的黄豆样大小皮疹，表面角化过度，可有明显的粗糙感，同时可伴有瘙痒。
组织病理检查：可见表皮角化亢进，棘层肥厚，呈乳头瘤增生。在棘细胞上层及颗粒层内可见空泡化细胞。该细胞核小而圆，嗜碱性，周围似一狭窄的晕。表皮要延长，而疣周围的表皮突向中心弯曲呈抱球状，真皮乳头上延，血管扩张。
其他检查：HPV病毒抗体检查以及DNA检查阳性。
二、尖锐湿疣实验室检查
1.醋白试验：用5%醋酸液涂抹皮损处，3—5分钟后变白色。(十分实用而简便的办法)
2.碘黄试验：用鲁戈氏液涂后3分钟，发黄者可以确诊为尖锐湿疣。
3.皮损活检：发现有HPV感染的特征性凹空细胞的组织病理变化特点。(较可靠的办法)
4.必要时在皮损活检中用抗原或核酸检测显示有HPV感染。常见的是HPPV6、11型。目前多应用快速敏感及特异性很高的聚合酶链式反应，阳性率可达80%左右。当真性和假性尖锐湿疣鉴别困难时，可用HPV-DNA原位分子杂交进行鉴别，此法是目前一种敏感性和特异性很高的鉴别手段，阳性率可高达90%以上。