慢性结肠炎病因复杂，诊断尤其为重要，应做一系列检查。检查能帮助医生排除其他能够引起类似症状的疾病，比如克罗恩病，肠易激综合征者憩室炎。
在包括血检、粪检的一系列检查中，结肠镜检查尤其重要。慢性结肠炎必须通过内窥镜检查才能明确炎症的不同范围和病变的程度，从而明确诊断。慢性结肠通过病理检查和连续定期的内窥镜追踪检查后，不断调整治疗方案，才能使结肠炎得到合理的有效治疗。奥林巴斯电子全结肠镜优势：集检查、诊断及治疗功能于一身，图像清晰，镜头精巧景深大，能直接观察到人的升结肠、横结肠、降结肠的肠道黏膜病变、肿瘤病变，对早期结肠癌的检查予以精确检查，其另一重要功能是：可对结肠息肉进行镜下治疗。