对慢性结肠炎长期患者或愿意反反复复的患者，建议可以用中药进行治疗，比如国药准字诃苓止泻胶囊效果很好，同时注意一下饮食习惯。慢性结肠炎经过及时适当的治疗，一般预后良好；但部分患者由于肠道反复在肠炎症刺激下损伤、修复，最终可能导致肿瘤的发生。因此，慢性结肠炎患者进行正确的保健十分重要。平时加强锻炼，增强体质，加强饮食卫生和水源管理；不吃腐败变质的食物，不喝生水，生吃瓜果要烫洗。要注意休息和增加营养。另外，应保持心情舒畅、避免强烈刺激、树立战胜疾病的信心。
用药原则
慢性结肠炎的治疗用药，关健是在组方。大便次数多不一定就用补药，要辨证和辨病相结合，健脾和中和通补通用相结合，既要扶正，又要祛邪，扶正就是治本，祛邪就是要消除炎症。
慢性结肠炎 - 益生元调理法
每年的秋冬季节患肠炎的人就会大大增加，大多是因为饮食因素如饮食不卫生引起的腹泻。肠道内感染是引起腹泻的主要原因，食物容易被细菌病毒等微生物污染，并大量繁殖，容易引起疾病。导致慢性结肠炎的因素有很多，但归纳起来主要有两种，一是指肠道感染了细菌、霉菌等病毒，使肠道长期处于炎症状态，二是由于人的身体过度疲劳、长期处于营养不良状态、情绪波澜起伏不定等，这些因素都可以诱发慢性结肠炎的发生。中医认为慢性结肠炎是虚寒性下利的一种表现，它与脾胃、肝、肾功能的失调有着密切的关系。
慢性结肠炎的自我保健要遵循八字方针：预防为主，重在调理。
肠道其实很娇贵，秋冬季要注意保暖，而除了避免受凉外，平时可以补充异麦芽低聚糖进行调理，肠炎患者更是可以长期服用。
异麦芽低聚糖又称分歧低聚糖，是益生元的一种，与直键型麦芽低聚糖不同之处在于异麦芽低聚糖分子中含有α－1，6糖苷键。由于其可促使人体内的双歧杆菌显著增殖，具水溶性膳食纤维功能，热值低、防龋齿等特性，所以是种应用广泛的功能性低聚糖，目前市面上异麦芽低聚糖产品主要以立健这类的养肠保健品为代表。