1、原发性十二指肠炎。病因尚未完全明确，可能与进食刺激性食物、饮酒、药物（如非甾体抗炎药）、幽门螺杆菌感染等有关。本病亦可伴发十二指肠其他疾病或肝胆胰等周围器官疾病，常与慢性胃炎、消化性溃疡病等合并存在，故认为可能与其病因相同。有人认为十二肠炎可演变为十二指肠溃疡，其依据为：
（1）炎症开始时酸度正常，以后由于炎症进展干扰了十二指肠对胃液分泌的抑制过程，导致高酸产生而形成溃疡。
（2）十二指肠炎时表皮细胞因炎症破坏而丧失，但腺管部细胞增殖可以予以补偿。当腺管细胞因衰竭而不能补偿丧失时，可产生糜烂，继之形成溃疡。
2、特异性十二指肠炎。多由克罗恩病、肠结核、寄生虫（如钩虫、兰氏贾第鞭毛虫等）及真菌、嗜酸粒细胞性胃肠炎等累及十二指肠而引起特异性炎症。