本病尚无特效疗法，对症处理好高热、抽搐、和呼吸衰竭等危重症状，对降低病死率和防止后遗症，具有重要意义。
1、一般护理：
隔离治疗，对昏迷病人，应注意口腔、皮肤清洁护理，定时翻身侧卧，受压部位放置气垫，应用牙垫或开口器，防止舌咬伤。流质饮食，热量每日不低于35~40Cal/kg，并注意补充维生素B、C以及清凉饮料和葡萄糖液。
2、高热治疗：以物理降温为主，如冷敷、冰袋放置、30~40%酒精擦浴，冷盐水灌肠等。
药物一般用小剂量醋柳酸、氨基比林口服，也可肌肉注射安热静成人1~2支，小儿10mg/kg，肌肉注射;赐他静，成人2ml肌肉注射，小儿酌减; 柴胡注射液，成人2ml/次，小儿1~1.5ml/次，肌肉注射，必要时3~4小时重复使用。
高热伴有抽搐患者可应用亚冬眠疗法，冬眠灵与非那根各 1ml/kg，肌肉注射或静脉滴注，每4~6小时可重复给药。并给予阿米妥、水化氯醛或鲁米那（对高热不退、超高热伴反复抽搐者作为诱导剂）。一般用 1~3天，应逐渐减少剂量及延长用药时间。
3、惊厥治疗：
（1）宜早用，在有抽搐先兆、高热、烦燥，惊厥及肌张力增加时，即与应用;
（2）肌肉松弛后即停;
（3）掌握剂量，注意给药时间。用药如下：
安定：成人10~20mg/次，小儿0.1~0.3mg/kg（不超过10mg/次），肌肉注射，必要时缓慢静注。
水合氯醛：成人1~2g/次，小儿100mg/岁/次，（1次不>1g），鼻饲或保留灌肠。
阿米妥钠：成人0.2~0.5g/次，小儿5~10mg/kg，可用葡萄糖液稀释成2.5%溶液肌肉注射或缓慢静注至肌强直变软为止。
苯巴比妥钠：成人0.1~0.2g/次，小儿5~8mg/kg次，肌肉注射。
25%硫酸镁：0.2~0.4ml/kg/次，肌肉注射，或稀释后静注，但推注要慢，注意呼吸抑制及休克（必要时可用钙剂对抗）。
4、呼吸衰竭的治疗：
（1）保持呼吸道畅通：定时翻身拍背、吸痰、给予雾化吸入以稀释分泌物。
（2）给氧：一般用鼻导管低流量给氧。
（3）气管切开：凡有昏迷、反复抽搐、呼吸道分泌物堵塞而致发绀，肺部呼吸音减弱或消失，反复吸痰无效者，应及早气管切开。
（4）应用呼吸兴奋剂：在自主呼吸未完全停止时使用效果较佳。可用洛贝林、可拉明、利他林等。
（5）应用血管扩张剂：近年报道认为用东莨菪碱、山莨菪碱有一定效果。前者成人0.3~0.5mg/次，小儿0.02~0.03mg/kg/次，稀释后静注，20~30分钟1次;后者成人20mg/次，小儿0.5~1mg/kg/次，稀释后静注，15~30分钟1次。
（6）应用脱水剂：脑水肿所致颅内高压是乙脑常见的征象，亦为昏迷，抽搐及中枢性呼吸衰竭的原因，并可形成脑疝，故应及时处理。其具体方法：20% 甘露醇或25%山梨醇，1~2g/kg次，15~30分钟推完，每4~6小时一次。有脑疝者可用2~3g/kg。应用脱水疗法注意水与电解质平衡。
（7）必要时应用人工呼吸机。
5、脑水肿及脑疝治疗：
20%甘露醇或25%山梨醇，1~2g/kg/次，静脉快滴或推注（20~30分钟），每隔4~6小时可重复1次，疗程2~4天。有脑疝者开始给甘 露醇2~4g/kg，或加用速尿或利尿酸钠。
氢化考的松：成人100~300mg/d，儿童5~10mg/kg/d，静脉滴注3~5天，也可用相当剂 量的地塞米松。
6、皮质激素：多用于中、重型病人，有抗炎、减轻脑水肿、解毒、退热等作用。氢化考的松5~10mg/kg/日或地塞米松10~20mg/日，儿童酌减。
7、能量合剂：细胞色素C、辅酶A、三磷酸腺甙等药物有助脑组织代谢，可酌情应用。
8、应用免疫增强剂：
乙脑患者细胞免疫功能低下，近年虽有使用转移因子、免疫核糖核酸、乙脑疫苗、胸腺素等治疗者，但疗效尚不能肯定。干扰素亦可试用。