黄疸型乙型肝炎整个病程一般分黄疸前期、黄疸期和恢复期三个阶段，病程2-3个月。主要表现为恶心、肝区疼痛、食欲不振、黄疸等。
（1）黄疸前期
黄疸前期，一般持续2～7日，多数起病缓慢，可有畏寒发热，主要症状为乏力、食欲减退、恶心呕吐、肝区胀痛、腹胀、便秘或腹泻等。某些病例有明显的上呼吸道症状，类似感冒。本期体征不显著，部分病例有浅表淋巴结肿大。于本期末小便颜色加深，继而巩膜及皮肤先后出现黄染。
（2）黄疸期
巩膜、皮肤出现黄染，约1周左右达高峰，部分病人短期内可出现肝内梗阻性黄疸的临床表现，黄疸日益加深，皮肤瘙痒，大便呈淡灰白色，肝多肿大，质地充实有压痛、叩击痛。约10％的病人脾肿大。肝功能检查有明显异常，本期病程2～6周左右。
（3）恢复期
这一阶段，大约持续2～3周，有的持续1～2月。这一时期黄疸已退，食欲恢复，精神和体力也逐渐恢复。肝功转氨酶逐渐下降一直到正常。肝肿大也逐渐恢复。但是肝脏实质的真正完全康复还需半年左右。而急性无黄疸型肝炎的症状和体征与急性黄疸型肝炎相同，不同之处在于无黄疸型肝炎无黄疸，其它症状和体征也轻。
有人观察有部分甲型肝炎患者在急性期病情恢复后，可再次出现病情复发(黄疸和转氨酶升高)，少数患者呈慢性经过。有报道病程迁延达1年之久，黄疸持续时间最长达33个月。