干眼症患者最主要的症状是眼部感觉有异物感、干燥感、眼痒，外界刺激、感情冲动不流泪，畏光，丝状粘性分泌物增多，眼痛及烧灼感，疲劳感，结膜反复充血，痉痒感，视力波动等。有六成患者症状为感觉到持续性异物感和眼干燥感，其次有三成患者症状是感觉到疲劳感、畏光。另外，如果泪液产生不足或蒸发过多均可引起眼部刺激症状，产生烧灼感。
干眼症患者晚期眼表面组织可出现增厚、溃疡或瘢痕形成、新生血管生长等症状。如果角膜形成瘢痕，则可引起视力下降。
假如患者常时间干眼没有得到治疗，较严重者眼睛会出现红肿、充血、角质化、角膜上皮破皮而有丝状物黏附等症状，这种损伤日久则可造成角结膜病变，并会影响日后视力。