小儿胃肠炎的治疗主要是病因治疗和对症治疗，就是说，急性胃肠炎是由什么原因引起的，设法查出并及时消除这个病根子。孩子出现什么症状，就设法消除这个对身体有害的症状。
假如是由消化不良引起的，可以调整饮食并服用乳酶生、酵母片等;假如是由身体的其它疾病引起的，可选用抗生素并在医生指导下使用;假如是由身体的其它疾病引起的，就积极治疗这个疾病;假如是不合理使用抗生素引起的，就需请教医生，使抗生素的使用合理化。
孩子呕吐、腹泻失水过多，要及时补充水和电解质;发高烧时，采用物理或药物降温;缺钾补钾，缺钙补钙;有代谢性酸中毒或休克时，应及时送医院急救。