胎心与母亲之间存在胎壁屏障，药物通过胎壁屏障才进入胎儿体内，从而产生药物反应，因为有些药物可以通过胎壁屏障，对胎儿有致畸作用，因此，用药应谨慎，大部分药物在妊娠期的作用与非妊娠期相同，但由于妊娠期血容量以及肝脏代谢的不同，有些药物会更加敏感。
孕早期(胚胎期)，尤其是停经5周-10周，药物对胚胎的影响最大，同一种药，相对而言孕晚期用药比孕早期用药影响略小，但个别药物在孕晚期仍不宜使用。用药原则：尽量少用药，如需要应在医生指导下用药。对于一些孕期常见的疾病，孕妇可以在医生指导下合理用药：
1、感冒
感冒是孕妇孕期比较常见的疾病，孕妇感冒后应根据症状决定用药，注意休息，均衡营养，多饮水，不去公共场所，适当锻炼，增加免疫力。
2、腹泻
孕期腹泻会引起孕妇脱水、电解质紊乱，影响营养物质的吸收，影响胎儿的生长发育，严重时还会流产或早产。孕妇若是腹泻，首先要了解腹泻原因，若为感染性腹泻，应用抗生素治疗，无论如何，若腹泻严重，则应看医生，在医生指导下补液并纠正电解质紊乱。
3、贫血
有些孕妇在怀孕期间会出现贫血、血糖异常等情况，贫血应了解何种原因，若缺铁性贫血，轻者给予铁剂口服，重者则给予铁剂注射，必要时输血，若为巨细胞性贫血，则检查原因，对症处理。出现血糖异常，应做糖耐量实验等检查，了解是妊娠期糖尿病还是糖尿病合并妊娠，可给予饮食、运动、血糖控制不好应予以胰岛素治疗。
目前我国对孕妇的用药借用了美国药物和食品管理局制定的标准，按药物的不同危害分级如下：
A级药物：对孕妇安全，对胚胎、胎儿无害，如适量维生素A、维生素C、维生素D、维生素E等。
B级药物：对孕妇比较安全，对胎儿基本无危害，如青霉素、红霉素、地高辛、胰岛素等。
C级药物：仅在动物实验研究时证明对胎儿致畸或可杀死胚胎，未在人类研究中证实，孕妇用药需要权衡利弊，确认利大于弊时方能应用，如庆大霉素、异丙嗪、异烟肼等。
D级药物：对胎儿危害有确切证据，除非孕妇用药后有绝对效果，否则不考虑应用，如硫酸链霉素（使胎儿第8对脑神经受损、听力减退等）、盐酸四环素（使胎儿发生腭裂、无脑儿等）等要在万不得已时才使用。
X级药物：可使胎儿异常，在妊娠期间禁止使用，如甲氨蝶吟（可致胎儿唇裂、腭裂、无脑儿、脑积水、脑膜膨出等）、乙烯雌酚（可致阴道腺病、阴道透明细胞癌）等。
妊娠前3个月，以不用C、D、X级药物为好。出现仅仅情况必须用药时，也应尽量选用确经临床多年验证无致畸作用的A、B级药物。
1、怀孕就诊要注意月经期。应告诉医生自己已怀孕和妊娠时间；有受孕可能时，用药需要注意月经是否过期。
2、不能自行用药。准妈妈的疾病同样会影响胎儿，因此既不能滥用药物，也不能有病不用。不能自选自用药物，一定要在医生的指导下使用已证明对胚胎与胎儿无害的药物。
3、可用可不用的药物应尽量不用或少用。尤其是在妊娠的前3个月，能不用的药或暂时可停用的药物，应考虑不用或暂停使用。
4、用药必须注意孕周，严格掌握剂量、持续时间。
5、坚持合理用药，并且控制后及时停药。
6、两种以上的药物或有相同或相似的疗效时，应考虑选用对胎儿危害较小的药物。有A、B类药物可用，则应选用A类药。在无A、B类药可用选时，慎用C类药。D类药只有无其他药物可选用且准妈妈病重急需用药时才选用。对于未经动物实验以及临床资料报道证实有无危害的药物尽量不用。因为无资料证实不等于没有危险。
7、肯定的致畸药物禁用。
8、能单独用药就避免联合用药，能用结论比较肯定的药物就不用比较新的药物。
9、孕期禁用试验性用药，包括妊娠试验用药。