pH值是衡量女性健康的标准之一，如果长期使用避孕套的话，女性体内的pH值可发生改变，一旦患上妇科炎症而没有得到及时有效治疗的话，可对女性的生育能力造成影响。
相关的机构报道，国内约九成的成年女性生殖系统处于亚健康状态，如果女性生殖系统pH值在2-9之间，就不利于精子“活跃”，容易造成不孕。而且性交过于频繁的话，会导致致病性厌氧菌和加特纳菌大量繁殖。
更值得注意的是，避孕套中的油脂，大部分属于碱性润滑剂，长期使用的话容易造成体内的酸碱平衡失调，一旦造成生殖感染疾病，对女性的正常生育可造成威胁。不过，和避孕药等其他避孕方式比起来，避孕套的安全性会更高，不能因为怕影响生育而停止使用避孕套。