1、感染：自然流产可能会合并感染，不全流产的女性发生率会比较高。感染可局限在子宫腔内，也可以蔓延到子宫周边，以至超出生殖器官而生成腹膜炎、败血症。
2、大失血：有时候不免流产或不全流产可导致严重大失血，以至休克。
3、胎盘息肉：可致成严重子宫出血，多于流产后几星期内发生。
4、急性肾功衰竭：流产后可因为急性大量失血及严重感染发生休克而引发急性肾功衰竭。
5、子宫复旧不好：增大的子宫在流产后可能会不能顺利收缩。
6、月经不调：自然流产可能会造成月经不调。但月经不调的原因有很多，可能是流产后子宫黏膜受到一定的损害所致。也可能是精神紧张、过度劳累、内分泌失调、心理因素造成。
7、心理：自然流产会对准妈妈心理产生影响。其实自然流产可以被认为是一种有利于优生的自然淘汰，不必为此忧虑。愉快的情绪，会加速流产后身体的康复，有益于健康。
8、下次怀孕是否有影响：第一次怀孕的自然流产对下次怀孕有没有影响，不好一概而论。首先要排除是否有一些影响这次怀孕的因素存在，如怀孕前、怀孕期间身体不适、剧烈运动或者服用某些药物等。如果是这些因素导致的自然流产，对下次怀孕影响不大。另外，还要排除女性身体的一些器质性问题，如子宫或产道疾病等。还有就是女性身体的其他问题，这类原因就要查明，并需要经恰当治疗。如果没有外围影响因素，也没有这些病变，一般来说，下次怀孕问题不大。
9、自然流产是一种淘汰缺陷胎儿的一种机制，不完全有害。