1、许多漂浮在空去中或者是散落在灰尘里、物品上的各种微生物，一旦温度、湿度适宜时，它们就会快速地生长、繁殖，所以，抵抗力相对较弱的老人、儿童等人群吸入细菌后容易感染。另外，加湿器使用不当还可能引发“加湿性肺炎”。这是因为加湿器在使用时，若得不到定期清理，加湿器中的霉菌等微生物随着气雾进入空气，再进入人的呼吸道中，容易患“加湿性肺炎”。
2、潮湿的空气会加重关节炎、糖尿病的病情，所以，关节炎、糖尿病患者慎用空气加湿器。
3、如果直接向加湿器中加入自来水的话，容易污染室内空气，因为自来水中的氯原子和微生物有可能随水雾吹入空气中造成污染;如果自来水硬度较高，加湿器喷出的水雾中因含有钙镁离子，会产生白色粉末，污染室内空气。
4、虽然加湿器能够将干燥的室内空气加湿让人感觉清凉，但是超声波加湿器的辐射非常大，特别对于孕妇来说就更加严重了，所以孕妇尽量少用加湿器或者不用。