目前，特发性血小板减少性紫癜的诊断主要是排除性诊断，诊断要点包括至少2次检查血小板计数减少，血细胞形态无异常（当血小板<50x10^9/L时才有症状）；脾一般不大;骨髓检查，巨核细胞正常或增多（至少不减少），而成熟性血小板减少，血小板抗体测定多为阳性;排除其它引起血小板减少的疾病，如再生障碍性贫血，药物性血小板减少，妊娠合并HELLP综合症，遗传性血小板减少等。通过以上诊断，并结合临床症状可诊断特发性血小板减少性紫癜。
对于可能患有特发性血小板减少性紫癜的患者可通过血常规检查血小板，外周血涂片，骨髓涂片，艾滋病毒（HIV）和丙型肝炎病毒（HCV）检测以及免疫球蛋白定量的检测来进行诊断性排除。