硒存在于很多食物中，硒丰富的食物主要是龙虾、鱼及一些甲壳类水产品;其次是动物的心、肝、肾等脏器。此外，蔬菜中如荠菜、芦笋、豌豆、大白菜、南瓜、洋葱、番茄等也含一定量的硒，谷物的糠皮中也含有少量硒。
在含硒的食物中蛋类含硒量多于肉类，每100 克食物中，猪肉含硒10.6 微克，鸡蛋含硒23.6 微克，鸭蛋含硒30.7 微克，鹅蛋含硒33.6 微克，人参含硒15微克，花生含硒13.7 微克，所以，补硒尽量多进食含硒高的蛋类，肉类次之。而植物性的食物硒含量通常受当地水土中硒含量的高低影响，补硒的效果不便评估。
动物肾的含硒量是肝的4倍，而肝的含硒量又比肉类高4倍，蛋类含硒量多于肉类，瘦肉中以牛肉含硒最高。从调查数据看，天然食品硒含量从高到低，大致顺序为海产品、动物内脏、鱼、蛋、肉、粮食、牛奶(粉)、蔬菜、水果。