潜伏期长短不一，4天～19年，绝大多数在1年以内。影响潜伏期的因素为年龄(儿童较短)、伤口部位(头面部发病早)、伤口性质(深咬伤较短)和入侵病毒的数量、毒力及宿主防御机制等。典型临床经过可分为3期。
潜伏期：潜伏期10日至1年以上，一般为20～90日，超过3个月者约占15%。
前驱期：多有低热、头痛、倦怠、周身不适、食欲不振、恶心、烦躁、恐惧不安，继而对痛、声、光、风等刺激敏感，并有咽喉紧缩感。较有诊断意义的早期征候是已愈合的伤口，伤口附近及其神经通路处有麻木、痒、痛等异常感觉，四肢有蚁走感。本期持续2～4日。
兴奋期：患儿逐渐进入高度兴奋状态，表现为极度恐怖、恐水、怕风、发作性咽肌痉挛、呼吸困难等。多数患者在饮水、见水、听到流水声甚至听到水字便可引起咽喉肌严重痉挛。患儿极度口渴，但不敢饮水，常致声嘶及脱水。对风、光、触动等刺激不仅可引起咽肌痉挛，严重发作时尚可致全身疼痛性抽搐及由呼吸肌痉挛而致的呼吸困难、缺氧及紫绀。因交感神经功能增强，可出现大汗、流涎、心率增快、血压升高。患儿神志多清醒，但部分患儿可出现定向力障碍、幻觉、谵妄、精神失常。本期1～3日。
麻痹期：痉挛发作减少或停止，患儿渐趋安静。肢体呈弛缓性瘫痪，亦可出现眼肌、颜面肌及咀嚼瘫痪症状。进而进入昏迷状态，可因呼吸和循环衰竭而迅速死亡。本期持续6～18小时。