肥胖的原因迄今尚未完全阐明，一般认为与下列因素有关。
1、遗传：父母中有一位是肥胖者，其子女肥胖机率为40%至50%；父母皆为肥胖者，其子女肥胖机率为70%至80%。
2、饮食习惯：若家长任由孩童吃高脂及高热量食物，而且经常要他们吃光所提供的食物，甚至以奖励方式来鼓励孩子吃东西，容易令孩子变得肥胖。
3、心理代偿作用：当儿童心理不安、紧张或受挫折时，会找来甜食、高热量食物，以不断进食来填补心理不安，养成进食过量的习惯。
4、服用药物：如抗过敏药物、性激素、类固醇、抗抑郁药、抗癫痫药等。
5、生理因素：可能源自于患者本身的新陈代谢较亢进，内分泌失调、染色体异常、大脑控制饱食饥饿中枢失控或疾病等因素。