疝气在婴幼儿中的发生率为4%左右，一般多见于男宝宝，早产儿发生疝气的几率更高。为了给疝气患儿制定最有效的治疗和护理方案，首先需要明确小儿疝气的病因。
在妊娠期，胚胎腹股沟处有一“腹膜鞘状突”，可以帮助睾丸降入阴囊或子宫圆韧带的固定。但有些孩子出生后，此鞘状突关闭不完全，反而成为较大的腔隙，腹腔内容物就会从这里突向体表，而形成斜疝，导致腹腔内的小肠，网膜，卵巢，输卵管等进入此鞘状突，即成为疝气；若仅有腹腔液进入阴囊内，即为阴囊水肿。有些男孩因为右侧睾丸下降比左侧略晚，鞘状突闭锁也较迟，故右侧腹股沟疝较多。当然，女孩也可因腹壁薄弱形成斜疝，只是发病率非常低。
有些孩子由于脐部发育缺陷脐环未闭合，或脐带脱落后脐带根部组织与脐环粘连愈合不良，在腹内压力增高的情况下，网膜或肠管即经脐部薄弱处突出形成脐疝。
此外，中医认为疝气的形成和患儿的体质有着很大的关系。中医认为，疝气病是由于孩子发育不健全或由于体质虚弱、中气不足、寒气、湿气、浊气、怒气乘虚进入导致气血运行受阻不畅滞留，腹腔内产生负压，导致腹腔内气压增大，迫使腹腔内的游离脏器如：小肠、盲肠、大网膜、膀胱、卵巢、输卵管等脏器见孔就钻，也就是说导致疝气的根本原因就是气血不畅。
除了先天原因外，一些后天因素，如孩子咳嗽、打喷嚏、啼哭或排便用力过度、腹部过肥等原因都会引起小儿疝气。