诊断小儿支原体肺炎常用的检查项目有：
一、外周血 白细胞计数大多正常，可有增多，但也有白细胞减少者。
二、血生化 血沉增快，多为轻、中度增快。抗O”抗体滴度正常。部分病儿血清转氨酶、乳酸脱氢酶、碱性磷酸酶增高。
三、MP检测 早期患儿可用PCR法检测患儿痰等分泌物及肺组织中MP-16SRDNA或P1黏附蛋白基因，亦可从痰、鼻分泌物、咽拭子中分离培养出MP。
四、血清抗体检测 血清抗体可通过补体结合试验、间接血球凝集试验、酶联免疫吸附试验、间接免疫荧光试验等方法测定，或通过检测抗原得到早期诊断。
五、痰、鼻和喉拭子培养 可获肺炎支原体，但需时约3周，同时可用抗血清抑制其生长，也可借红细胞的溶血来证实阴性培养。发病后2周，约半数病例产生抗体。
六、红细胞冷凝集试验阳性，滴定效价在1∶32以上，恢复期 效价4倍增加的意义大。40～50%病例的链球菌MG凝集试验阳性，血中出现MG链球菌凝集素效价为1∶40或更高，滴度逐步增至4倍则更有意义。
七、X线检查 X线改变分为4种：
1、以肺门阴影增浓为突出；
2、支气管肺炎改变；
3、间质性肺炎改变；
4、均一的实变影。体征轻微而胸片阴影显著，是本病特征之一。有时伴胸腔积液，肺部X线变化较快也是其特点之一。
八、心电图和B超 必要时应检查心电图和B超，以明确有无心肌损害和肝脏损害。
支原体感染除了累及肺部外，可伴有肺外的表现，也有单以肺外表现为首发症状。故儿童如有发热、咳嗽，合并其他器官的症状，如心跳快、气短叹息等，应及时到医院就诊，早期治疗，避免各器官继续受损。
如发现患儿伴有心跳、胸闷、气促等症状时，须注意患儿并发心肌炎的可能，应让小儿卧床休息，停止进行剧烈的体力运动，避免加重心脏损害。