首先，轻微肠胃炎，不经治疗也可自行痊愈。但是在日常中，急性肠胃炎在儿童肠胃炎中最为常见，下面介绍急性肠胃炎的治疗方法：
1、注意补液，避免脱水
注意脱水现象：小朋友是否有小便减少（婴儿换尿布次数减少），干哭没有眼泪，皮肤干无弹性，婴儿之前囟门凹陷等现象？无论有无接受点滴注射，都可购买拉肚子专用之电解质水给小朋友当开水喝。
当孩子意识水平下降或者脱水相当严重时，静脉注射是十分必要的。但口服补液疗法依然是一种很好的补液方法。富含单糖的饮料，例如汽水，果汁等，不推荐给5岁以下的孩子使用，因为它们可能会加重腹泻。如果没有特效的口服补液剂或者味道较差，白开水也是可以使用的。如有适应症，也可以在儿童身上使用鼻饲胃管来补充流质。
2、注意饮食，继续母乳喂养
母乳喂养的婴儿建议继续以平时的喂养方法。
配方奶喂养的婴儿在ORT补液后立即继续配方喂养。可先试着冲泡着半奶（即浓度稀释一半）看看。若拉肚子的情形无法在3-7天内改善，可能需在医师指示下换无乳糖奶粉（即市售之医泻奶粉）。
3、止吐药
止吐药物可能有助于治疗小儿呕吐，但一定要谨遵医嘱服用。昂丹司琼有一定实用，单次使用即可减少静脉输液需求、住院需求及呕吐。但是昂但司琼的使用可能与小儿再次入院几率增加有关。如果临床上需要，昂丹司琼的静脉液也可以口服。胃复安可能有效。
4、抗生素
抗生素不通常用于肠胃炎，但如果症状特别严重时或在找到了易感细菌、怀疑某细菌感染的情况下是建议使用的。世界卫生组织（ＷＨＯ）建议对同时有便血和发烧的小儿应使用抗生素。
5、止泻药物
小儿不能用止泻药——可能产生危险。止泻药物在理论上有并发症的风险，虽然临床经验表明这种可能性不大，在便血或伴有发烧的腹泻情况下不建议使用。洛派丁胺是一种阿片类似物，常用于腹泻的对症治疗。但洛派丁胺不适于用于儿童，因为此药物可能会穿越儿童尚未成熟的血脑屏障，引起中毒。小儿的肠胃炎比成人肠胃炎的复杂得多，一定要看医师。
儿童肠胃炎住院指标
当病童有持续高烧不退超过48小时，合并有呕吐、严重腹泻，一天拉肚子次数大于10次，应给予住院治疗，此外因为腹泻导致严重脱水（体重明显下降与尿量明显减少）加上精神懒散食欲不振，经由药物电解质液的治疗方式无效也应住院治疗。